Error : El ordenador se queda colgado al arrancar

Buenas,

Hace 2 dias inserté una tarjeta de red WIFI en el equipo, total que se me desconectaron todos los cables al cambiarla. Una vez coloqué la tarjeta inserte los cables en las ranuras adecuadas.
Cuando encendí el ordenador ví que tardaba mas de lo habitual y entonces fue cuando me empezó a dar problemas. Ara mismo el ordenador solo me inicia pero en cuanto se ponen a cargar programas se queda pillado, como si se quedase saturado. He conseguido ver que durante el arranque el disco trabaja al 99-100% no sé si este será el problema o será algún componente de la placa base que se me ha jodido por que si que hizo una cosa muy rara al iniciarse.
Espero haberme explicado con claridad y pido ayuda a ver si alguien tiene alguna idea de que le puede pasar. El ordenador no tiene más de 1 año y no debería dar problemas ya que nunca me los ha dado.

Muchas gracias,
Sergio