Puerto PCI-E o tarjeta gráfica?

Hola, les cuento antes que nada las características de mi equipo:
*Sistema operativo Windows 7 Home Premium SP1 x64, Linux Ubuntu 12.04 LTS
*Micro Intel Core i5 2500K Sandy Bridge 3,3 Ghz
*4 Gb RAM
*HD Seagate 750 Gb.
*Placa gráfica Nvidia GT 520 1 Gb DDR3
*Placa madre Gigabyte, modelo H61M-S2V-B3

El problema en concreto que tengo, es que hace unos días mi equipo comenzó a funcionar mal y me he dado cuenta que tengo problemas ya sea con la tarjeta gráfica o con el puerto PCI-E y no se cual de los dos es, ya que quité la tarjeta, la probé en otro equipo y funcionó. Hice lo mismo con mi PC, probé otra aceleradora en ella y anduvo bien! entonces me surge el interrogante de si es la tarjeta o el puerto. ¿Hay alguna manera de verificar esto? Gracias!