EL USO DEL DISCO AL 100??

Hola, tengo un problema.
Hace dos meses compre una pc armada. I CORE 5, 4 GB de Ram, Disco de 500GB con windowas 8.1 pro de 64 bits y esta funcionando correctamente.
De hace 2 semanas a la fecha se ah empezado a llenar el uso del disco hasta el 100%, y cuando inicio secion tarda como 2 minutos en iniciar completamente.
La cuestion es que me infecte del llamado virus policia hace como 1 mes y la formate y volvi a instalar todo con mas cuidado, pero ahora me aparecio este problema.
Investigue y dicen que es problema de compativilidad del disco, pero instale el 7 ultimate en una partidura y me corre perfecto. Otros dicen que es un malware. Pero nadie me dice como solucionarlo.
Alguna sugerencia, lo agradeceria demaciado.