Perdida de archivos

Hola,
En mi usb tengo guardados unos achivos, cuando la conecte a mi portatil, empezo el antivirus a detectar muchos win32 troyanos, yo los elimine, pero ahora mis archivos no aparecen por ningun lado, aun asi mi memoria sigue ocupando el espacio de los archivos desaparecidos............. ¿que hago? en donde estan mis archivos?