Portatil extremadamente lento

Buenos días,
Hace dos días instalé el Emule para descargarme música, y varias canciones tenían virus (las detectó el antivirus y las bloqueó, mi antivirus es Avast). Ayer fui a encender el portátil y tardó como 10min en arrancar. Tarda 5min en salir el logo de Windows. Restauré el sistema, pasé el avast, el ccleaner y otro programa anti-malware y no se encontró nada. Sigue igual de lento. Me metí en internet y una posibilidad es que con dos antivirus la cosa se estropeaba. El mismo día que instalé el Emule, desinstalé el antivirus que venía por defecto "Trend internet security" (o algo así), que había tenido junto al Avast durante todo este tiempo sin saberlo.
Cuando enciendo el portátil parece como si no arrancara a la velocidad que debiera. El LED que indica que el ordenador está "pensando" parpadea apenas cada 5segs. Cuando Windows se carga e introduzco el usuario parece ir más deprisa. A la hora de trabajar con el ordenador, cuando abro una ventana, aparece de forma muy lenta, como si el ordenador no pudiera ir más deprisa porque algo se lo impide. Luego al cerrarla, también va desapareciendo poco a poco. Un vídeo de Youtube se ve en fotos continuadas, no como video. Sin embargo, procesos como cambiar una carpeta de 1GB a otro destino apenas tarda 5 segundos.
Parece que los mayores problemas, cuando es más lento, es a la hora de cargar el sistema y lo relacionado con él. Otros procesos son tan rápidos como siempre.
Tiene alguien idea de que le podría pasar?
Muchas gracias por todo.