Parche de windows 7

Tengo una duda, hace unos días instale windows 7 ultimate que no es original, luego ayer busque como activar windows y encontre un programa llamado loader extreme y segui los pasos del vídeo tutorial y si se activo, pero al encender la computadora me aparece un mensaje que dice:
iniciar con
windows 7
windows 7 loader exe
y si inicio con la opción windows 7 abre el windows que no esa activado y si escojo la otra opción aparecen el windows activado con las mismos archivos.
¿No le afecta en nada a mi computadora si mi windows funciona así? ¿Los archivos no le afectan en nada? o ¿Debería eliminar esa opción de windows e instalar de nuevo el windows 7, pero esta vez para activarlo con otro programa llamada "remove wat"?