Virus troyano

Hola,
agradezco si me podéis decir si al pasar una carpeta de musica de un disco duro externo (limpio) a un portatil (infectado con el virus troyano) si el disco duro externo se puede infectar. No se ha pasado información del portatil infectado al disco externo. Si es posible, me gustaria saber como limpiar el disco externo en caso de virus, sin seguir infectando otro equipo.
Gracias a todos