Seguridad en un pendrive

Soy docente y a menudo los alumnos me entregan sus trabajos en archivos digitales, pero siempre que un alumno copia su archivo corremos el riesgo de que, en un descuido mio, borre (para hacer una broma o por maldad) otro que ya estaba en la memoria USB y que no le pertenecía. ¿Existe forma de proteger una carpeta de manera que solo pida una contraseña si se quieren extraer documentos de la misma?