Para garantizar la compatibilidad y portabilidad, los sistemas Linux cumplen con el estándar FHS (Estándar de jerarquía del sistema de archivos). La jerarquía básica es la siguiente:
/
La raíz, que contiene los directorios principales
/bin
Contiene archivos ejecutables fundamentales del sistema, utilizados por todos los usuarios (como por ejemplo los comandos ls, rm, cp, chmod, mount, etc.).
/boot
Contiene los archivos que permiten que Linux se inicie
/dev
Contiene los puntos de entrada para los periféricos
/etc
Contiene los comandos y los archivos que el administrador del sistema necesita (archivos passwd, group, inittab, ld.so.conf, lilo.conf, etc.)
/etc/X11
Contiene los archivos específicos para la configuración de X (XF86Config, por ejemplo)
/etc/opt
Contiene los archivos de configuración específicos para las aplicaciones instaladas en /opt
/home
Directorio personal del usuario
/lib
Contiene bibliotecas compartidas que son fundamentales para el sistema durante su inicio
/mnt
Contiene puntos de montaje de particiones temporales (CD-ROM, disquete, etc.)
/opt
Contiene paquetes de aplicaciones suplementarias
/root
Directorio del administrador de raíz
/sbin
Contiene los sistemas binarios fundamentales (por ejemplo, el comando adduser)
/tmp
Contiene archivos temporales
/usr
Jerarquía secundaria
/usr/X11R6
Este directorio se reserva para el sistema X versión 11.6
/usr/X386
Éste es un vínculo simbólico con /usr/X11R6, el cual utilizó previamente X versión 5
/usr/bin
Contiene la mayor parte de los archivos binarios y los comandos del usuario
/usr/include
Contiene los archivos de encabezado para los programas C y C++
/usr/lib
Contiene la mayoría de las bibliotecas compartidas del sistema
/usr/local
Contiene datos que pertenecen a los programas instalados en la raíz del equipo local
/usr/local/bin
Binarios de programas locales
/usr/local/games
Binarios de juegos locales
/usr/local/include
Archivos de encabezado locales de C y C++
/usr/local/lib
Bibliotecas locales compartidas
/usr/local/sbin
Binarios del sistema local
/usr/local/share
Jerarquía independiente
/usr/local/src
Archivos fuente locales
/usr/sbin
Contiene los archivos binarios que no son fundamentales para el sistema y que se reservan para el administrador del sistema
/usr/share
Reservado para datos independientes de la arquitectura
