No puedo instalar mi sistema operativo en mi disco duro de 500gb

Hola,

tengo una pc con dos discos duros sata.. el problema es que uno no es mio y lo tengo que devolver, asi que decidi instalar el sistema en el mio que es de 500gb, el otro es de 250gb.. bueno cuando instalo el sistema en disco de 500gb todo parece funcionar bien, hasta que desconecto el de 250gb y entonces mi pc dice que no hay sistema, trate de desconectar el de 250gb eh instalar en el de 500gb el sistema.. pero siempre que el de 250gb no este conectado me dice que el disco es incompatible con windows.. ya no se que hacer, no puedo usar mi pc con ningun disco que no sea el de 250 porque sin el todo lo demas deja de funcionar